Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Gm340F6RGI3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Gm340F6RGI3 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms