Protein–RNA interactions for Protein: F2Z3Y9

2610001J05Rik, RIKEN cDNA 2610001J05 gene, mousemouse

Predictions only

Length 59 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
2610001J05RikF2Z3Y9 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
2610001J05RikF2Z3Y9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms