Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Taf4E9QAP7 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Flot1-201ENSMUST00000001569 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Taf4E9QAP7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms