Protein–RNA interactions for Protein: E9QA62

Lmod3, Leiomodin-3, mousemouse

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmod3E9QA62 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Lmod3E9QA62 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Psmd3-201ENSMUST00000017365 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Cnih3-202ENSMUST00000161880 1995 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Zfp651-201ENSMUST00000093772 6353 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Fancm-201ENSMUST00000058889 7775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Lmod3E9QA62 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms