Protein–RNA interactions for Protein: E9QA15

Cald1, Caldesmon 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 768 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cald1E9QA15 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Cald1E9QA15 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Cald1E9QA15 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.5 ms