Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9W7

Pdzd7, PDZ domain-containing 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdzd7E9Q9W7 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Pdzd7E9Q9W7 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Pdzd7E9Q9W7 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms