Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9U8

Ccdc74a, Coiled-coil domain-containing 74A, mousemouse

Predictions only

Length 364 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc74aE9Q9U8 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ccdc74aE9Q9U8 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ccdc74aE9Q9U8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms