Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7P9

Cdhr2, Cadherin-related family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdhr2E9Q7P9 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Izumo1r-201ENSMUST00000034409 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Cdhr2E9Q7P9 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Cyp26c1-201ENSMUST00000073391 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Slc25a35-202ENSMUST00000102606 1828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cdhr2E9Q7P9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.4 ms