Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6R1

Itga10, Integrin, alpha 10, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga10E9Q6R1 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Itga10E9Q6R1 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Itga10E9Q6R1 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms