Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6E9

Simc1, SUMO-interacting motifs-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Simc1E9Q6E9 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Keap1-206ENSMUST00000216436 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Rbm18-201ENSMUST00000028251 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Simc1E9Q6E9 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Simc1E9Q6E9 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms