Protein–RNA interactions for Protein: E9Q492

Pgbd1, PiggyBac transposable element-derived 1, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgbd1E9Q492 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Pgbd1E9Q492 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms