Protein–RNA interactions for Protein: E9Q1J0

Zfp558, Zinc finger protein 558, mousemouse

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Length 407 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp558E9Q1J0 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.26
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Zfp558E9Q1J0 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Zfp558E9Q1J0 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Zfp558E9Q1J0 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp558E9Q1J0 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Zfp558E9Q1J0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Zfp558E9Q1J0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
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