Protein–RNA interactions for Protein: E9Q0V3

Vmn1r68, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 319 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r68E9Q0V3 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm42882-201ENSMUST00000201788 506 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Nudcd2-201ENSMUST00000020578 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Vmn1r68E9Q0V3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Vmn1r68E9Q0V3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms