Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

Predictions only

Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Ddx60E9PZQ1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ddx60E9PZQ1 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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