Protein–RNA interactions for Protein: E9PZ26

Brd1, Bromodomain-containing 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd1E9PZ26 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Brd1E9PZ26 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Brd1E9PZ26 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms