Protein–RNA interactions for Protein: E9PXM3

Vmn1r177, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r177E9PXM3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Vmn1r177E9PXM3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Vmn1r177E9PXM3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms