Protein–RNA interactions for Protein: E9PWW9

Rsf1, Remodeling and spacing factor 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsf1E9PWW9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Rsf1E9PWW9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Kcnk3-201ENSMUST00000066295 3811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Rsf1E9PWW9 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms