Protein–RNA interactions for Protein: E9PVA8

Gcn1, eIF-2-alpha kinase activator GCN1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,671 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gcn1E9PVA8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Gcn1E9PVA8 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm18187-201ENSMUST00000196476 984 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm39228-201ENSMUST00000212456 301 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 U2af2-202ENSMUST00000165399 1810 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Eid2b-201ENSMUST00000094651 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Rhbdl2-201ENSMUST00000053202 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm20444-201ENSMUST00000174014 648 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gm42934-201ENSMUST00000196920 1345 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Gcn1E9PVA8 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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