Protein–RNA interactions for Protein: E0CXF8

BC035044, cDNA sequence BC035044, mousemouse

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Length 138 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BC035044E0CXF8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Smn1-202ENSMUST00000091321 223 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC035044E0CXF8 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC035044E0CXF8 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
BC035044E0CXF8 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
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BC035044E0CXF8 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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BC035044E0CXF8 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
BC035044E0CXF8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
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