Protein–RNA interactions for Protein: D3Z7A4

Gm21560, Predicted gene, 21560, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21560D3Z7A4 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gm21560D3Z7A4 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 4931413I07Rik-201ENSMUST00000173637 764 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gm21560D3Z7A4 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms