Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6W3

Rdh8, Retinol dehydrogenase 8, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh8D3Z6W3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Galk1-201ENSMUST00000021114 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Fam213a-201ENSMUST00000022317 1537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Rdh8D3Z6W3 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Rdh8D3Z6W3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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