Protein–RNA interactions for Protein: D3Z6J4

Vpreb3, Pre-B lymphocyte gene 3, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vpreb3D3Z6J4 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Mael-201ENSMUST00000038782 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.65
Vpreb3D3Z6J4 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.96□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Cacna1g-203ENSMUST00000103166 8104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm6209-202ENSMUST00000194629 1506 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ferd3l-201ENSMUST00000061035 886 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Tbc1d4-209ENSMUST00000161991 6483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Hectd3-201ENSMUST00000050067 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 St8sia2-201ENSMUST00000026896 5368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Zc3h13-201ENSMUST00000022577 6151 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Vpreb3D3Z6J4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.6 ms