Protein–RNA interactions for Protein: D3Z3K2

Ccnb1ip1, E3 ubiquitin-protein ligase CCNB1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Hoxc6-201ENSMUST00000001711 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 2810474O19Rik-209ENSMUST00000189932 5269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Ccnb1ip1D3Z3K2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ccnb1ip1D3Z3K2 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms