Protein–RNA interactions for Protein: D3Z2H9

Tpm3-rs7, Tropomyosin 3, related sequence 7, mousemouse

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tpm3-rs7D3Z2H9 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Tpm3-rs7D3Z2H9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Tpm3-rs7D3Z2H9 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms