Protein–RNA interactions for Protein: D3Z1D3

3425401B19Rik, RIKEN cDNA 3425401B19 gene, mousemouse

Predictions only

Length 1,412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
3425401B19RikD3Z1D3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
3425401B19RikD3Z1D3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
3425401B19RikD3Z1D3 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
3425401B19RikD3Z1D3 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms