Protein–RNA interactions for Protein: D3YYI7

Rnf217, Probable E3 ubiquitin-protein ligase RNF217, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf217D3YYI7 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf217D3YYI7 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
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