Protein–RNA interactions for Protein: C6EQI3

Gm17333, ASL1 fusion protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17333C6EQI3 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Plxna1-202ENSMUST00000163139 9034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Acp5-204ENSMUST00000213815 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Acp5-206ENSMUST00000217643 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm16262-201ENSMUST00000162306 1751 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm17333C6EQI3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms