Protein–RNA interactions for Protein: B9EKR1

Ptprz1, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase zeta, mousemouse

Predictions only

Length 2,312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprz1B9EKR1 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Epc1-202ENSMUST00000050542 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Psmb5-202ENSMUST00000227257 622 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Pacsin3-203ENSMUST00000111349 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Dok5-201ENSMUST00000029075 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Ptprz1B9EKR1 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms