Protein–RNA interactions for Protein: B9EKE5

Catip, Ciliogenesis-associated TTC17-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatipB9EKE5 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm14091-201ENSMUST00000133534 874 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Cobll1-202ENSMUST00000102726 5031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Cobll1-203ENSMUST00000112429 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm12953-201ENSMUST00000138426 751 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CatipB9EKE5 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CatipB9EKE5 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms