Protein–RNA interactions for Protein: B9EHT4

Clip3, CAP-Gly domain-containing linker protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clip3B9EHT4 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Fndc4-202ENSMUST00000172435 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Trnt1-202ENSMUST00000113247 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Clip3B9EHT4 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Dlgap1-209ENSMUST00000140728 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Clip3B9EHT4 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms