Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Gm6133B2RY53 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Gm6133B2RY53 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms