Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC1

Trappc11, Trafficking protein particle complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 1,133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc11B2RXC1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Trappc11B2RXC1 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Trappc11B2RXC1 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms