Protein–RNA interactions for Protein: B2RX88

Cspp1, Centrosome and spindle pole associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cspp1B2RX88 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cspp1B2RX88 Zfp692-201ENSMUST00000049353 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Depdc7-201ENSMUST00000028595 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Dstn-201ENSMUST00000103172 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Mthfd2-201ENSMUST00000005810 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 H19-202ENSMUST00000136359 2286 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 AC107452.1-201ENSMUST00000227963 481 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Cspp1B2RX88 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms