Protein–RNA interactions for Protein: B2RWG3

Siah3, E3 ubiquitin-protein ligase, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah3B2RWG3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Siah3B2RWG3 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Siah3B2RWG3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.9 ms