Protein–RNA interactions for Protein: B2RRF6

Znf518a, Zinc finger protein 518A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,478 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518aB2RRF6 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Gm11906-201ENSMUST00000124792 680 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Sbf2-213ENSMUST00000171218 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Znf518aB2RRF6 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Znf518aB2RRF6 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms