Protein–RNA interactions for Protein: B1AWZ3

Nipsnap3a, Nipsnap homolog 3A, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nipsnap3aB1AWZ3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Nipsnap3aB1AWZ3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Nipsnap3aB1AWZ3 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms