Protein–RNA interactions for Protein: B1AWN9

Tnfrsf25, Tumor necrosis factor receptor superfamily, member 25, mousemouse

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf25B1AWN9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Zfp800-203ENSMUST00000115321 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Tnfrsf25B1AWN9 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Tnfrsf25B1AWN9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms