Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Rd3-201ENSMUST00000175680 1969 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Rrs1-201ENSMUST00000072079 2048 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
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Trabd2bB1ATG9 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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Trabd2bB1ATG9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Trabd2bB1ATG9 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
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