Protein–RNA interactions for Protein: B1AT01

1700084M14Rik, RIKEN cDNA 1700084M14 gene, mousemouse

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700084M14RikB1AT01 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
1700084M14RikB1AT01 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Rasgrp2-224ENSMUST00000167240 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
1700084M14RikB1AT01 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms