Protein–RNA interactions for Protein: B1ASB6

Spocd1, SPOC domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 936 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spocd1B1ASB6 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 S1pr5-201ENSMUST00000122088 2500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Spocd1B1ASB6 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms