Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Usp36B1AQJ2 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms