Protein–RNA interactions for Protein: A6X8J1

Gm16430, Predicted gene 16405, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm16430A6X8J1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Gm16430A6X8J1 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Atxn7-201ENSMUST00000022257 6853 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Gm16430A6X8J1 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms