Protein–RNA interactions for Protein: A6NAS3

Gm3173, Alpha6-takusan, mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3173A6NAS3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Dpf1-203ENSMUST00000108230 1553 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Ube2cbp-201ENSMUST00000034986 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gm3173A6NAS3 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Pdia6-201ENSMUST00000057288 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Gm45906-201ENSMUST00000208911 1430 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Gm3173A6NAS3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms