Protein–RNA interactions for Protein: A3KGV1

Odf2, Outer dense fiber protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf2A3KGV1 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Idnk-204ENSMUST00000226010 1898 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Ubr3-201ENSMUST00000055758 8072 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Odf2A3KGV1 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms