Protein–RNA interactions for Protein: A3KGF9

Ccdc9b, Coiled-coil domain-containing protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc9bA3KGF9 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ccdc9bA3KGF9 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Crtap-201ENSMUST00000084881 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccdc9bA3KGF9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms