Protein–RNA interactions for Protein: A3FIN4

Atp8b5, Phospholipid-transporting ATPase FetA, mousemouse

Predictions only

Length 1,183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp8b5A3FIN4 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Atp8b5A3FIN4 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Rbm39-202ENSMUST00000109584 667 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Atp8b5A3FIN4 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms