Protein–RNA interactions for Protein: A2RTF1

Catsperb, Cation channel sperm-associated protein subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CatsperbA2RTF1 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
CatsperbA2RTF1 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
CatsperbA2RTF1 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms