Protein–RNA interactions for Protein: A2RT60

Htra4, Serine protease HTRA4, mousemouse

Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htra4A2RT60 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Bsg-202ENSMUST00000105381 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Htra4A2RT60 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Ikzf5-203ENSMUST00000128432 714 ntTSL 3 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Pcbp1-201ENSMUST00000053015 1830 ntAPPRIS P1 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Htra4A2RT60 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.4 ms