Protein–RNA interactions for Protein: A2AT37

Upf2, UPF2 regulator of nonsense transcripts homolog (yeast), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,269 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Upf2A2AT37 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Upf2A2AT37 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Upf2A2AT37 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms