Protein–RNA interactions for Protein: A2AKG8

Focad, Focadhesin, mousemouse

Predictions only

Length 1,798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FocadA2AKG8 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Nfatc2-205ENSMUST00000137451 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
FocadA2AKG8 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
FocadA2AKG8 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms